Truyện tranh "Blue Box" xoay quanh cuộc sống học đường của hai nhân vật chính là Taiki và Chinatsu. Taiki là một cầu thủ bóng rổ nổi tiếng, đẹp trai và rất được ngưỡng mộ trong trường. Trong khi đó, Chinatsu là một cô gái có vẻ ngoài mộc mạc, hồn nhiên và có niềm đam mê với việc vẽ tranh.
Một ngày nọ, Taiki tình cờ phát hiện ra sở thích của Chinatsu và bắt đầu để ý đến cô gái này. Dần dần, mối quan hệ giữa họ trở nên gần gũi hơn khi Taiki bắt đầu trò chuyện với Chinatsu về tranh vẽ và cùng nhau tham gia vào các hoạt động nghệ thuật.
Tuy nhiên, mâu thuẫn nảy sinh khi Taiki phải đối mặt với sức ép từ việc phải chứng minh bản thân trong đội bóng rổ và ước mơ được thi đấu ở cấp cao hơn. Mặt khác, Chinatsu bắt đầu phát triển tài năng về tranh vẽ và quyết định tham gia một cuộc thi lớn.
Khi cả hai đều đứng trước ngưỡng cửa quan trọng của cuộc đời, họ phải đối diện với những tình cảm, lựa chọn và định hướng riêng. Cuộc sống đưa đẩy họ vào những tình huống đầy căng thẳng, và sự phát triển của từng nhân vật cũng khiến cho người đọc không thể đoán trước được kết quả cuối cùng của câu chuyện.
