Trên hành tinh giả tưởng Digital World, nhóm Digimon dũng cảm dẫn đầu bởi Taiki và những người bạn chiến đấu giành lại hòa bình trong thế giới hỗn loạn. Trận chiến khốc liệt với quỷ vương Bagramon đang đạt đến đỉnh điểm. Thời điểm quyết định đã đến, khi Taiki và nhóm phát hiện ra một âm mưu đen tối đang ẩn sau hậu quả của cuộc chiến này.
Khi tất cả dường như đã thất bại, một Digivice bí ẩn với sức mạnh mới xuất hiện, mở ra cánh cửa tới một thế giới song song khác. Taiki quyết định mạo hiểm bước vào thế giới này, nơi mà sự bi kịch và truyền thuyết gặp nhau. Những thử thách mới khám phá, những tình bạn mới tại đây đã khiến Taiki đưa ra những quyết định khó khăn: tiếp tục chiến đấu hay nhường sân khấu cho những người mới?
Kết hợp giữa sự đấu tranh vì công lý, bí ẩn của Digivice mới, và sự phát triển tâm lý chi tiết của các nhân vật, Digimon Xros Wars như một cuộc phiêu lưu kịch tính nơi mà ranh giới giữa tốt và xấu, quyền lực và trách nhiệm đã được đặt ra.