Truyện tranh "Handsome Na Kanojo" xoay quanh cuộc sống của cô gái trẻ Haruka, một nghệ sĩ vẽ tranh tài năng nhưng luôn che giấu vẻ đẹp của mình sau lớp trang điểm dày. Một ngày, cô gặp được Takumi, một chàng trai điển trai nhưng lại tự ti về bản thân vì không được công nhận vẻ ngoại hình của mình. Hai con người này đã dần dần hòa mình vào căn bệnh tự ti của đối phương, hỗ trợ nhau và đồng thời cùng nhau trưởng thành hơn.
Tuy nhiên, một biến cố bất ngờ đã xảy ra khi Haruka phát hiện ra sự thật đằng sau vẻ ngoại hình lạnh lùng của Takumi: anh chỉ là một vẻ đẹp được tạo ra từ photoshop và ảnh hưởng từ áp lực xã hội. Sự thật này khiến cả hai người đều choáng váng, nhưng đồng thời hiểu ra rằng bản thân không nên đánh giá mình qua vẻ ngoại hình. Haruka và Takumi quyết định vượt qua nỗi tự ti, chấp nhận bản thân thật của mình và tiếp tục hướng tới ước mơ của mình một cách tự tin hơn.