Truyện tranh "Kiếp Thiên Vận" xoay quanh câu chuyện về một phòng học kỳ lạ tại trường Trung học Nam Hải. Được mệnh danh là "Phòng học 404", nơi đây từ lâu đã trở thành đề tài đồn đại trong giới học sinh. Mọi người cho rằng phòng học này bị ma ám bởi linh hồn của một học sinh đã qua đời một cách bí ẩn.
Hikari, một học sinh mới chuyển đến trường, tò mò quyết định khám phá bí ẩn đằng sau Phòng học 404. Cô mở cánh cửa đổ kênh sáng chói từ bên ngoài soi vào, nhưng thay vì bước vào một không gian bình thường, Hikari bất ngờ trượt ngã và rơi thẳng vào một thế giới song song khác.
Ở đây, Hikari phát hiện ra một bí mật kinh hoàng: Những linh hồn bị mắc kẹt ở đó đã biến thành những vật dụng hàng ngày không hồn khí. Trên cánh cửa mỗi linh hồn, ghi rõ ngày giờ họ qua đời. Hikari nhận ra rằng chỉ có thể giúp đỡ họ thoát khỏi vòng luẩn quẩn này nếu cô giúp họ hoàn thành một nhiệm vụ không thể đơn giản hơn: hiểu và chấp nhận sự chấm dứt.
Nhưng điều đáng sợ nhất chính là khi Hikari phát hiện ra linh hồn mà cô đang cố gắng giúp đỡ chính là của một người thân quen từ quá khứ của mình... liệu cô có thể vượt qua nỗi sợ hãi và tìm ra sự thật đằng sau "Kiếp Thiên Vận" kì bí này?